Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp3Q9QY23 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp3Q9QY23 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms