Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nufip1Q9QXX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms