Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ChmQ9QXG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms