Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ptf1aQ9QX98 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptf1aQ9QX98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptf1aQ9QX98 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms