Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc5Q9QX29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc5Q9QX29 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 420.1 ms