Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyth1Q9QX11 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyth1Q9QX11 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyth1Q9QX11 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms