Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV9

Ccnt1, Cyclin-T1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnt1Q9QWV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccnt1Q9QWV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnt1Q9QWV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnt1Q9QWV9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms