Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdcQ9QW08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms