Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms