Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prg3Q9JL95 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prg3Q9JL95 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prg3Q9JL95 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms