Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gde1Q9JL56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms