Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a3Q9JKZ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms