Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ldb3Q9JKS4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms