Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx5Q9JKQ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms