Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod2Q9JKK7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmod2Q9JKK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod2Q9JKK7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod2Q9JKK7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms