Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem1Q9JKE2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.6 ms