Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ap3m1Q9JKC8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ap3m1Q9JKC8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap3m1Q9JKC8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms