Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng4Q9JJV4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng4Q9JJV4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms