Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfra4Q9JJT2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms