Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl3Q9JJR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ascl3Q9JJR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms