Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Caln1Q9JJG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caln1Q9JJG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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