Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2aQ9JIS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2aQ9JIS5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sv2aQ9JIS5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2aQ9JIS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2aQ9JIS5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms