Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms