Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms