Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn10Q9ESK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn10Q9ESK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn10Q9ESK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms