Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm7Q9ESD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms