Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc4Q9ES56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms