Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParvbQ9ES46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ParvbQ9ES46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms