Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrnb2Q9ERK7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms