Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms