Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn12Q9ER56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn12Q9ER56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms