Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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