Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
V1ra8Q9EQ48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms