Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SyncQ9EPM5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SyncQ9EPM5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms