Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gpr88Q9EPB7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr88Q9EPB7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr88Q9EPB7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr88Q9EPB7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr88Q9EPB7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr88Q9EPB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms