Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Serpina1fQ9DCQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpina1fQ9DCQ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms