Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan4Q9DCK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms