Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms