Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn2Q9DBR1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms