Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp27a1Q9DBG1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp27a1Q9DBG1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms