Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ftsj3Q9DBE9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms