Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg9Q9DB90 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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