Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH2

Znrf4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf4Q9DAH2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znrf4Q9DAH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znrf4Q9DAH2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znrf4Q9DAH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms