Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D9S1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D9S1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9S1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9S1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9S1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms