Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TcimQ9D915 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TcimQ9D915 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms