Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms