Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1Q9D883 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms