Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbe1Q9D6Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbe1Q9D6Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms