Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr42e1Q9D665 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms