Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnbd2Q9D5U8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnbd2Q9D5U8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnbd2Q9D5U8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnbd2Q9D5U8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnbd2Q9D5U8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnbd2Q9D5U8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnbd2Q9D5U8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms